MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 3823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007607	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007607	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007607	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007607	TGAA	2	8	135	142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007607	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007607	CCG	2	6	289	294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524409
8	NC_007607	TTC	2	6	297	302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524409
9	NC_007607	CAA	2	6	307	312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524409
10	NC_007607	GTCA	2	8	373	380	25 %	25 %	25 %	25 %	82524408
11	NC_007607	AAT	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524408
12	NC_007607	TTG	2	6	648	653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524408
13	NC_007607	TCA	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524408
14	NC_007607	GAT	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524408
15	NC_007607	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007607	GTAG	2	8	842	849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007607	AATT	2	8	854	861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007607	AAT	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007607	AAGA	2	8	896	903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007607	T	7	7	950	956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007607	AAG	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007607	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007607	AT	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007607	ATA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007607	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007607	TCA	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007607	AGC	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007607	T	7	7	1183	1189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007607	GA	3	6	1192	1197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007607	ATG	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007607	TCTA	2	8	1223	1230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007607	ACA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524410
33	NC_007607	A	6	6	1297	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
34	NC_007607	AGT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524410
35	NC_007607	AATA	2	8	1361	1368	75 %	25 %	0 %	0 %	82524410
36	NC_007607	ATG	3	9	1369	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524410
37	NC_007607	TGC	3	9	1388	1396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
38	NC_007607	A	7	7	1409	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
39	NC_007607	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524410
40	NC_007607	TCA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524410
41	NC_007607	ACAA	2	8	1532	1539	75 %	0 %	0 %	25 %	82524410
42	NC_007607	CTG	2	6	1645	1650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
43	NC_007607	TCTT	2	8	1655	1662	0 %	75 %	0 %	25 %	82524410
44	NC_007607	CT	3	6	1673	1678	0 %	50 %	0 %	50 %	82524410
45	NC_007607	T	7	7	1682	1688	0 %	100 %	0 %	0 %	82524410
46	NC_007607	A	7	7	1718	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
47	NC_007607	CTG	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524410
48	NC_007607	AAG	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524410
49	NC_007607	TAT	2	6	1892	1897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524410
50	NC_007607	TAA	2	6	1898	1903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524410
51	NC_007607	TAG	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007607	ATC	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007607	ATA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007607	CAT	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007607	ATT	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007607	TTA	2	6	2104	2109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007607	T	6	6	2126	2131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007607	T	6	6	2174	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007607	T	6	6	2193	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007607	ATC	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007607	AATT	2	8	2218	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007607	AAAT	2	8	2235	2242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007607	TCT	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524411
64	NC_007607	T	6	6	2266	2271	0 %	100 %	0 %	0 %	82524411
65	NC_007607	CAA	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524411
66	NC_007607	CCG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524411
67	NC_007607	AGT	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524411
68	NC_007607	CGCT	2	8	2433	2440	0 %	25 %	25 %	50 %	82524411
69	NC_007607	TAC	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524411
70	NC_007607	GTT	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524411
71	NC_007607	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524411
72	NC_007607	TTAT	2	8	2644	2651	25 %	75 %	0 %	0 %	82524411
73	NC_007607	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	82524411
74	NC_007607	GTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524411
75	NC_007607	ATA	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524411
76	NC_007607	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	82524411
77	NC_007607	GAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524411
78	NC_007607	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007607	CAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007607	GCAGAA	2	12	3111	3122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007607	TTA	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007607	TGC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007607	GAT	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007607	CAC	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007607	AT	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007607	T	6	6	3359	3364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007607	A	8	8	3368	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007607	CATTG	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007607	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007607	ATT	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007607	TAAG	2	8	3518	3525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007607	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007607	TTG	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007607	AAATT	2	10	3598	3607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007607	TAAA	2	8	3615	3622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007607	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007607	TGA	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007607	T	7	7	3677	3683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007607	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007607	AT	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007607	T	19	19	3761	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007607	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007607	TAA	3	9	3965	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007607	AAGT	2	8	3978	3985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007607	GAA	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007607	TAT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007607	TCAG	2	8	4027	4034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007607	ATG	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007607	GCT	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007607	AGA	3	9	4240	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007607	AT	3	6	4266	4271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007607	T	6	6	4271	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007607	TTG	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007607	ATTCGG	2	12	4296	4307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007607	CATT	2	8	4378	4385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007607	CACTTA	2	12	4483	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007607	A	6	6	4612	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007607	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524412
119	NC_007607	G	7	7	4756	4762	0 %	0 %	100 %	0 %	82524412
120	NC_007607	ACT	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524412
121	NC_007607	CGA	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524412
122	NC_007607	CTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524412
123	NC_007607	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007607	ATT	2	6	5103	5108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007607	AT	3	6	5192	5197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007607	TG	3	6	5218	5223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007607	TAT	2	6	5224	5229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007607	TGT	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007607	CCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007607	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007607	TAT	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007607	AT	4	8	5343	5350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007607	GATA	2	8	5386	5393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007607	CAGAG	2	10	5405	5414	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007607	CAT	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007607	AAT	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007607	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007607	CAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007607	AG	3	6	5487	5492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007607	TAG	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524413
141	NC_007607	AAC	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524413
142	NC_007607	GTT	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524413
143	NC_007607	GCT	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524413
144	NC_007607	GCT	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524413
145	NC_007607	ACATC	2	10	5722	5731	40 %	20 %	0 %	40 %	82524413
146	NC_007607	CAC	3	9	5747	5755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524413
147	NC_007607	CCGG	2	8	5777	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	82524413
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166	NC_007607	GAC	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_007607	ATGT	2	8	11764	11771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
282	NC_007607	ATGT	2	8	11773	11780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007607	ATGT	2	8	11782	11789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_007607	TGG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_007607	GAA	2	6	18271	18276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524428
421	NC_007607	CTG	2	6	18356	18361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_007607	ATC	2	6	18402	18407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_007607	A	6	6	18434	18439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_007607	GCA	2	6	18563	18568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_007607	GCT	2	6	18615	18620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_007607	TTA	2	6	18621	18626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_007607	ATT	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_007607	AT	3	6	18719	18724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_007607	T	7	7	18793	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_007607	ATTAC	2	10	18823	18832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_007607	T	9	9	18848	18856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007607	AATA	2	8	18882	18889	75 %	25 %	0 %	0 %	82524429
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453	NC_007607	ATT	2	6	19522	19527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524429
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458	NC_007607	TAC	2	6	19660	19665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_007607	ACGA	2	8	19687	19694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
460	NC_007607	A	6	6	19717	19722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_007607	CAT	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_007607	GAC	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_007607	AG	3	6	20527	20532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_007607	CAT	2	6	20559	20564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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